Лабораторията извършва в зависимост от спецификата на хранителните продукти и хранителните добавки, специфичен микробиологичен анализ:
Патогенни детерминанти ( Salmonella, Listeria monocytogenes, E. coli, фекални стрептококи)
Определяне на дрожди и плесени
Определяне на НТЗ, колиформи, ентеробактерии и др.